آماده سازی آنزیماز ارگانیسم ها گرفته می شوند و به طور کلی ایمن تر هستند و می توانند با توجه به نیاز تولید در مقادیر مناسب مورد استفاده قرار گیرند. سه گروه عمده میکروارگانیسم ها وجود دارندآماده سازی آنزیم: قارچهای رشته ای ، مخمرها و باکتری ها ، عمدتا با استفاده از باکتری های خوب هوا. سویه ها و استفاده از چندین آنزیم اصلی صنعتی به شرح زیر است:
(1) آمیلازها
آمیلاز نشاسته را هیدرولیز می کند تا مالتو-الیگوساکاریدهای خمیری و مالتوز تولید کند. این ماده عمدتا توسط تخمیر غوطه ور Bacillus subtilis و Bacillus licheniformis از جنس باسیلوس تولید می شود و دومی آنزیم های مقاوم در برابر حرارت تولید می کند. علاوه بر این ، همچنین توسط غوطه ور و نیمه جامد تولید می شود تخمیر با سویه های Aspergillus و Rhizopus ، که برای فرآوری مواد غذایی مناسب است. آمیلاز عمدتا برای ساخت قند ، کاهش نساجی ، فرآوری مواد اولیه تخمیر و فرآوری مواد غذایی استفاده می شود. گلوکوآمیلاز می تواند نشاسته را به گلوکز هیدرولیز کند ، که اکنون تقریباً همه توسط Aspergillus niger تولید می شود تخمیر غوطه ور برای تولید شکر ، تولید الکل ، تخمیر فرآوری مواد اولیه و غیره
(2) پروتئاز
گونه ها و گونه های تولیدی که بیشترین استفاده را دارند. از Bacillus licheniformis ، Bacillus pumilus و Bacillus subtilis برای تولید پروتئاز باکتری با تخمیر غوطه ور استفاده کنید. از استرپتومایسس و تخمیر غوطه ور آسپرژیلوس برای تولید پروتئاز خنثی و پروتئیناز اسید آسپرژیلوس برای موزدایی چرم ، نرم شدن خز ، داروخانه و صنایع غذایی استفاده کنید ؛ برخی از باکتریهای جنس Mucor برای تولید پنیر تحت تخمیر نیمه جامد قرار می گیرند ، که جایگزین مایه پنیر در اصل از گوساله می شود معده در تولید پنیر
(3) گلوکز ایزومراز
گونه ای که در دهه 1970 به سرعت ایجاد شد. اولین ، از تخمیر غوطه ور برای بدست آوردن سلولهای استرپتومایسس استفاده می شود. پس از بی حرکتی ، محلول گلوکز به شربت حاوی حدود 50٪ فروکتوز تبدیل می شود. این شربت می تواند در صنایع غذایی به جای ساکارز مورد استفاده قرار گیرد. استفاده از آمیلاز ، گلوکو آمیلاز و ایزومراز گلوکز برای تولید شربت فروکتوز از نشاسته ذرت به یکی از صنایع قند در حال ظهور تبدیل شده است.
