سیستامین هیدروکلراید می تواند در ساخت مواد آرایشی ، مواد افزودنی خوراکی ، داروی ضد زخم استفاده شود ، همچنین می تواند در ساخت معرف بیوشیمیایی و عامل پیچیده یونهای گوشتی سنگین استفاده شود. این ماده می تواند با آنزیم بدن انسان واکنش نشان داده و عملکرد آن را در صورت وجود تابش تثبیت کند ، بنابراین می تواند در بهبود سندرم تابش و سم تترا اتیل سرب استفاده شود. می توان آن را به صورت قرص یا آمپول در آورد.